双向凝胶电泳是将不同种类的蛋白质按照等电点和分子量差异进行高分辨率分离的分析方法。成功的二维电泳可以将2,000~3,000种蛋白质进行分离，是目前唯一能同时分离成百上千种蛋白质的工具。