16S rDNA扩增子测序（16S rDNA Amplicon Sequencing），通常是选择某个或某几个变异区域，利用保守区设计通用引物进行PCR扩增，然后对高变区进行测序分析和菌种鉴定，16S rDNA扩增子测序技术已成为研究环境样品中微生物群落组成结构的重要手段。根据所扩增的16S区域特点，基于Illumina MiSeq或者Illumina HiSeq测序平台，利用双末端测序（Paired-End）的方法，构建小片段文库进行双末端测序。通过对Reads拼接过滤，OTUs（Operational