CHIP-seq技术是研究蛋白质与DNA相互作用的有力工具，利用该技术步进可以检测转录因子与DNA的动态作用、转录因子与基因表达的关系，还可以用来研究各种组蛋白修饰，染色质调控因子等。CHIP-seq技术已成为目前研究转录调控和表观遗传调控的重要手段。