实验流程蛋白质抽提:对组织样本中的蛋白进行抽提;酶解:抽提后的蛋白质进行酶解;酶解后的肽段混合物在高效纳升液相色谱上进行分离,并使用超高分辨率质谱仪对其进行检测;检测得到的结果使用软件进行定性以及定量分析。------------------------------------------------样品要求组织样本200 mg以上;血液样本100 ul以上;其他体液样本1 ml以上;请使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性;------------------------------------------------交付结果实验流程;前处理基本方法;LC-MS/MS参数;蛋白质定性、定量结果列表;差异蛋白筛选列表;差异蛋白生物信息学分析:GO注释,KEGG通路分析、蛋白质相互作用网络图分析等。
实验流程蛋白质酶解;酶解后的肽段混合物在高效纳升液相色谱上进行分离,并使用超高分辨率质谱仪对其进行检测;检测得到的结果使用软件进行检索分析。软件根据MS2谱图的信息,并结合经典的正反库搜库策略对MS2谱图进行解析,得到肽段鉴定结果,进而得到蛋白质鉴定结果,同时软件还对各个蛋白质的特征性肽段的峰面积进行统计,以色谱峰面积作为肽段的丰度表征,进而得出蛋白质的丰度值,最终得到样本间蛋白质的相对丰度比值。------------------------------------------------样品要求各个样本蛋白质总量在100ug以上;溶液样本须告知详细的溶液组成;请使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性;建议进行生物学重复分析。------------------------------------------------交付结果实验流程;前处理基本方法;LC-MS/MS参数;蛋白质定性、定量结果列表;
实验流程根据蛋白质的氨基酸序列合理选择蛋白酶;酶解;酶解后的肽段混合物在高效纳升液相色谱上进行分离,并使用超高分辨率质谱仪对其进行检测;使用国际主流的数据分析软件Byonic进行未知修饰鉴定。------------------------------------------------样品要求目的蛋白含量在20ug以上,纯度在80%以上;.溶液样本须告知详细的溶液组成;请使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性;------------------------------------------------交付结果实验流程;.前处理基本方法;LC-MS/MS参数;修饰鉴定结果。
实验流程根据目的蛋白序列进行蛋白酶的选择;酶解目的蛋白;酶解后的肽段混合物在高效纳升液相色谱上进行分离,并使用超高分辨率质谱仪对其进行检测;检测得到的结果使用软件进行检索分析。------------------------------------------------样品要求目的蛋白含量在20ug以上,纯度80%以上;溶液样本须告知详细的溶液组成;请使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性;建议进行生物学重复或者技术重复分析。------------------------------------------------交付结果实验流程;前处理基本方法;LC-MS/MS参数;蛋白质鉴定结果以及修饰鉴定结果。
实验流程多肽样本脱盐处理;Nanodrop检测多肽浓度;肽段混合物在高效纳升液相色谱上进行分离,并使用超高分辨率质谱仪对其进行检测;检测得到的结果使用软件进行检索分析。软件根据MS2谱图的信息,并结合经典的正反库搜库策略对MS2谱图进行解析,得到肽段鉴定结果,进而得到多肽所来源的蛋白信息,同时软件还可以对各个多肽进行色谱峰面积抽提,比较各个多肽的相对含量。------------------------------------------------样品要求各类多肽样本;多肽含量在30ug以上;溶液样本须告知详细的溶液组成;请使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性;建议进行生物学重复分析。------------------------------------------------交付结果实验流程;前处理基本方法;LC-MS/MS参数;多肽定性定量列表;差异多肽筛选列表。