成就人类健康事业
平台介绍 GeneScan技术平台在国家人类基因组北方中心成立之时开始筹建,至今已运行近14年。 平台建立初期主要服务于国家863、973等重大科技项目,在遗传性疾病致病基因定位方面做出了显著贡献。2004年GeneScan技术平台开始对外开展技术服务业务。其中全基因组扫描(致病基因定位)服务是我们的特色项目。诺赛GeneScan技术平台现有ABI3730XL仪器和Genemapper4.0软件,以及强大的技术力量和完善的客户服务体系,为许多科研院所提供专业、可靠、便捷的技术服务。GeneScan人全基因组扫描特色业务介绍 人致病基因定位(全基因组扫描) (特色服务) 全基因组扫描试剂盒选用ABI公司提供的,覆盖人类22对常染体的382个微卫星标记。该382个标记均来自于法国Genethon人类遗传多样性中心(CEPH)所发表的5264个微卫星标记(Dib etal,1996)。技术应用:利用特定的引物将人某条染色体上特定位置的微卫星扩增出来,并进行分析。利用平均分布于各条染色体上的密度约为10cM的微卫星,检测每个微卫星是否存在与其邻近的疾病相关基因座位连锁。最终将致病基因定位在某染色体的特定区域。 特定区域扫描 可根据客户指定的染色体区域寻找微卫星标记,进行定点扫描。技术应用:用于临床诊断方面如:为确定肝移植后肝癌复发病例中癌细胞来源问题,如发现肝癌细胞的微卫星等位基因型与病人相同,不同于供体细胞,说明肝癌细胞来自于病人本身,而不是来自于供体。用于已知致病基因所在染色体,利用特定的微卫星标记确定致病基因所在染色体的位置。送样要求: 因为产物中含有荧光标记所以送样时需要避光保存,可以用锡箔纸包裹样品。送样体积考虑到运输和实验过程中的损失建议您提供5微升以上的样品。需要纯化处理的样品提供20微升以上样品。 样品数量较多时建议您选用96孔板送样,这样可以有效避免样品在排板时发生错误。 外地样品因时间较长请选用96孔板并尽可能使用橡胶封口膜,这样可以有效保证样品在运输过程中不损坏、不损失,样品间也不易相互串孔污染。我们对于您的样品保存期限为1个月。如需返还请注明,逾期将销毁。 诺赛提供 1.Genemapper分析图谱(PDF格式)及原始fsa格式峰型图 2.各峰的相对分子量等具体信息(Excel格式) 3.完整实验报告(包括引物序列、扩增反应体系,实验步骤等) 4.数据分析软件及使用说明
应用领域: 需经过密码子优化以提高外源表达量的基因; 从组织样品中不易获得,但序列已知的基因; 需要特定突变的基因; 无法通过钓鱼法获得的或cDNA 文库中不表达、丰度极低、很难通过 PCR 法获取的基因; 用于微芯片的大量cDNA; 您所感兴趣的、自然界中还不存在的、对应蛋白表达与纯化的新基因。客户提供: 基因长度(bp)、克隆载体名称和长度(bp)和抗性以及选择的两端酶切位点。 完整准确的基因序列(按5’-3’的方向书写)。我们只根据您提供的序列进行基因合成,可以提供免费密码子优化,但是不提供基因序列的查询服务。 注明基因中是否含有如下特殊结构:GC含量是不是大于70%;含有超过100bp的重复序列;含有发夹环结构,含有未知复杂结构。 若需要密码子优化,请标明基因的起始密码子,表达宿主(拉丁名)以及序列中应该避免的酶切位点。 请在订购前咨询是否有合适载体。诺赛提供 : 1.基因合成报告单 2.测序图谱&质粒结构图 3.含正确基因序列的冻干质粒(约5ug,共2管) 4.含有相应质粒的甘油菌(约200ul/管,共1管) 5.实验报告(电子档)
客户提供提交引物合成订购表,其中包括引物名称、序列(5’-3’)、OD值、纯化方式等信息。 引物修饰合成类型 反义DNA合成BIOTIN修饰DNANH2及SH修饰DNADark Quenchers硫代碱基5’Biotin5’NH2 C63’BHQ -1DNA碱基3’Biotin3’NH2 C63’BHQ -22F-RNA中间Biotin dT5’NH2 C123’Dabcyl2’-O-Methyl碱基5’PC Biotin中间NH2 C6 dT5’Dabcyl5-Methyl dC5’Dual BiotinUni-Link NH23’Eclipse5’FITC(6-FAM)5’SH C63’SH C3Dual SH 诺赛建议反义DNA最好选用HPLC纯化,这样可以加强反义DNA的表现性能和降低产品中的盐份。反义DNA中如含有2F-RNA或5’FITC标记或5-Methyl dC,则免收HPLC纯化费。 所有BIOTIN修饰DNA、NH2及SH修饰DNA、Dark Quenchers DNA产品全部采用HPLC纯化。 碱基修饰DNASpacer修饰DNA其它修饰DNAdI (脱氧次黄嘌呤)C3 Spacer5’磷酸化dU (脱氧尿嘧啶)Spacer 93’磷酸化2-Aminopurine3’C6 Spacer5’地高辛5-Bromo dUSpacer 183’地高辛3’Inverted dTdSpacer5’CHCH(炔基)3’ddCPC Spacer5’CHO(醛基)5’COOH(羧基)5’Acrydite5-Nitroindole3’Cholesteryl 碱基修饰DNA、Spacer修饰DNA和其它修饰DNA产品需按实际情况选择纯化方式。 荧光标DNA吸收&发射波长(nm)双标记DNA探针分子信标5’6-FAM荧光基团淬灭基团荧光基团淬灭基团中间6-FAM-dT495&5205’6-FAM3’TAMRA5’6-FAM3’Dabcyl3’6-FAM495&5205’6-FAM3’BHQ-15’TET3’Dabcyl5’TET495&5205’6-FAM中间 BHQ-1 dT5’HEX3’Dabcyl5’HEX522&5395’6-FAM3’Eclipse5’TAMRA3’Dabcyl5’TAMRA538&5555’TET3’TAMRA5’CY53’Dabcyl3’TAMRA559&5835’TET3’BHQ-2中间TAMRA-dT559&5835’HEX3’TAMRA5’ROX559&5835’HEX3’BHQ-13’ROX588&6085’HEX3’BHQ-25’Texas Red588&6085’HEX中间 BHQ-1 dT5’ Cy3588&6085’TAMRA3’Eclipse中间Cy3550&5645’TAMRA3’BHQ-23’Cy3550&5645’ROX3’Eclipse3’Cy5550&5645’ROX3’BHQ-25’Cy5550&5645’CY53’BHQ-25’Cy5.5648&6685’CY33’BHQ-25’AMCA685&7065’JOE3’BHQ-23’AMCA353&4425’Texas Red3’BHQ-25’JOE353&4423’JOE529&555AlexaFluor488529&5555’Methylene Blue492&5173’Methylene Blue诺赛提供引物的冻干粉;引物说明书;最终引物。
实验流程------------------------------------------------样品要求 1、测序样品(可自备测序引物); 2、提交DNA测序登记单。 3、测序样品送样要求样品类型浓度体积备注已知浓度的未纯化的PCR产物大于50ng/ul≥30ul如果目标片段较大,需要相应增加样品体积未知浓度的未纯化的PCR产物3ul电泳检测应为明亮的一条带≥50ul纯化的PCR产物≥50ng/ul,条带务必单一,特异≥10ul请溶于不含DNA酶的双蒸水中,勿溶于TE,建议客户送原液来诺赛纯化提纯的质粒≥100ng/ul≥10ul大肠杆菌1ml新鲜过夜培养菌液,穿刺菌,平板菌,甘油菌,沉淀菌体或5ml成熟菌液,菌体所含质粒应为高拷贝,对于低拷贝表达载体(如pET系列),建议提供提纯的质粒单链DNA样品≥100ng/ul10ulBAC末端测序样品≥500ng/ul不少于2ugDNA噬菌体拒绝接收噬菌体上清以及被噬菌体污染的菌液,只接收提纯的噬菌体DNA大量测序样品多于48个样品,建议96孔板送样 4、自备的测序引物要求 PAGE纯化测序引物。 引物浓度不低于5 pmol/ul,不少于10ul。样品较多时,可以每个反应需5 pmol/ul引物1ul计算所需引物量。 引物Tm=50~60℃,18~25mer,GC含量40~60%。无4个以上连续GGGG,尤其3’端。 勿使用有荧光标记或其它标记的引物。 随机引物,混合引物不能用作测序。 一般,引物保质期限为一年。------------------------------------------------交付结果 1. 接收样品当天不计算在内,1~2个工作日内发送测序结果。对于送样时为甘油菌、刚接种的菌液以及含拷贝数低和大的质粒载体的菌液样品,3个工作日内发送测序结果。对于返工的反应,以发送结果当天为第一天,三日内发送返工测序结果。 2. 测序结果我们以压缩文件Zip形式发送,内含测序结果和《DNA测序报告》,其中: A,ab1为后缀的文件为测序图谱,请使用CHROMAS, BIOEDIT, DNAMAN 等软件打开。 B, Seq为后缀的文件为碱基序列,请使用NOTEPAD(记事本)或者DNAStar等软件打开。 C,《DNA测序报告》为HTML文件,请使用Internet Explorer等网络浏览器打开,该报告包含样品测序的详细信息,同时作为我公司与您对测序服务交流的重要书面材料,请认真查看。 3. 如需对您的样品测序进行实时跟踪和结果下载, 请登陆http://61.49.28.136/web, 向我公司查询用户名和密码,即可进入页面进行测序跟踪和结果下载。