服务简介

Label-free样本无需标记，直接采用液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，通过比较质谱信号强度和谱图计数，来分析不同来源样本蛋白量的变化。

应用领域：

1.动植物组织或细胞、微生物、体液的蛋白组鉴定和相对定量；

2.Pull-down方法或免疫沉淀方法富集的蛋白鉴定和相对定量。

技术优点：

1.所需样本量少，可对微量样本进行分析，不受样本数量限制；

2.检测动态范围可以达到4个数量级以上，提高了低丰度蛋白质的检测效率；

可选仪器：

QExactive、QExactive Plus、QExactive HF、Orbitrap Fusion

分析流程

样品经Trypsin 酶切，酶切产物由高精度质谱分析，数据由

Mascot等软件进行分析。

可选数据分析

1.数据产出统计；

2.蛋白质鉴定及定量结果；

3.蛋白质GO分析及差异蛋白GO分析；

4.蛋白质Pathway通路分析及差异蛋白的Pathway通路分析；

5.重复性分析（仅针对有重复设计的项目）；

6.多样品间表达模式聚类分析（适用于样本数≥3的项目）。

样品要求

蛋白提取物：≥50μg

细胞：≥10⁶

组织：动物组织≥1mg,植物组织≥10mg

体液：血清≥5μL，脑脊液≥10μL

参考文献

1、Zhu W, J.W. Smith, and C.M. Huang. Mass spectrometry-based label-free quantitative proteomics.J BIOMED BIOTECHNOL. 2010; 2010: p. 840518.

2、Ding C, Jiang J, Wei J, et al. A fast workflow for identification and quantification of proteomes,Mol Cell Proteomics. 2013 Aug;12(8):2370-80.

3、Niemann M, Wiese S, et al. Mitochondrial outer membrane proteome of Trypanosomabrucei reveals novel factors required to maintain mitochondrial morphology. Mol Cell Proteomics. 2013; 12(2): 515-28.

4、Vanderschuren H, Nyaboga E, et al. Large-Scale 2、Cholewa BD, Pellitteri-Hahn MC, et al. Large-Scale Label-Free Comparative Proteomics Analysis of Polo-Like Kinase 1 Inhibition via the Small-Molecule Inhibitor BI 6727 (Volasertib) in BRAFV600E Mutant Melanoma Cells. J Proteome Res. 2014 Jun 9.

5、Proteomics of the Cassava Storage Root and Identification of a Target Gene to Reduce Postharvest Deterioration. Plant Cell. 2014.