服务简介

一、 染色质免疫共沉淀测序概述

染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与新一代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。

ChIP-Seq首先通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP）特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，并对其进行纯化与文库构建，然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。

二、 染色质免疫共沉淀测序技术优势 
检测覆盖范围广：全基因组范围内扫描目标区域； 
检测分辨率高：更利于精确定位目标区域； 
样本需要量低：需要的免疫沉淀后的DNA量可低至5-10ng； 
可靠性好：避免了非特异性杂交，背景低； 
性价比高：花费较少即可检测全基因组，获取准确丰富的信息。 


三、 染色质免疫共沉淀测序研究内容 

通过富集peak检测，研究转录因子、RNA 聚合酶或其它蛋白在基因组上结合位点及其相关基因。提取peak区域的序列，寻找结合位点的motif，并对peak 进行基因、CpG 岛、GO和KEGG 等注释和分析。对于多个样品，可进行差异分析；

用于组蛋白修饰的表观遗传学研究。通过不同的特异性抗体检测DNA链的某一位置会出现何种组蛋白修饰，以及组蛋白修饰与基因表达的关系。