服务简介

一、概述

转录组学的研究对象包括mRNA和非编码RNA等。二代测序技术可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一个状态下几乎所有转录本的序列信 息和表达信息，从而准确地分析不同转录本的表达差异、基因结构变异、发现未知转录本和稀有转录本、筛选分子标记（SNPs或SSR）等生命科学的重要问题。

服务优势：

● 高质量的文库制备，采用KAPA的mRNA/核糖体去除RNA建库试剂盒
● 链方向特异性
● 常规建库样本量可低至100ng总RNA
● 扩增运用全球最强KAPAHiFi酶，有效降低扩增偏差和增强覆盖度
● 低丰度转录本覆盖度高

适用研究：

1）观察疾病发生过程中病灶部位内部的基因表达水平变化
2）在肿瘤研究中，使用RNA-seq技术可以预测潜在的融合基因
3）新lncRNA预测和已知lncRNA表达水平研究
4）新物种的转录组数据构建和功能研究

二、流程

三、数据分析

  1 、对原始数据进行质控，得出相应的质控报告，质控合格后进行后续分析。

  2 、对原始数据进行清洗过滤，去除低质量数据。

  3 、将数据比对到标准参考基因组，生成*.bam格式的数据。

  4 、将比对的结果（alignments）组装转录本。

  5 、将多个转录本集合合并成一套转录本集合。

  6 、衡量两个或多个样本间差异表达的基因，然后利用差异表达基因进行功能和通路分析。

 7 、利用比对结果数据进行新转录本预测、融合基因分析、SNP、Indel分析、对变异位点进行功能注释（多种注释数据库）等。