技术简介：

小RNA是一类重要的体内调节分子，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，从而调节细胞生长、分化，以及个体发育、生殖等重要生物学过程。采用高通量测序技术，一次性获得单碱基分辨率水平的数百万条小RNA序列信息，依托强大的生物信息学分析平台，鉴定已知小RNA，并预测新的小RNA及其靶标基因。

技术路线图：

 
生物信息学分析：

 
常规分析：
1.测序数据质控分析
2.高质量序列与miRNA数据库比对
3.小RNA分类及注释：miRNA, siRNA, piRNA, rRNA, tRNA, snRNA, snoRNA, repeat asscociated sRNA等
4.预测新的miRNA
5.miRNA靶基因预测
6.靶基因功能注释、GO富集分析和代谢通路富集分析
7.miRNA表达谱分析

高级分析：
8.样本间miRNA表达差异分析
9.与mRNA进行关联分析（需要有mRNA数据）

个性化分析：
10.根据客户需求进行个性化定制分析。


案例解析： 

                    （Jex, Aaron R., et al., 2014）

小RNA的差异表达分析

自组织热图分析揭示猪鞭虫的幼虫、成体及组织特异文库中小RNA的转录表达差异。

测序策略及数据量
测序策略：PE36或PE50
建议数据量：一般测序：10M reads 或15M reads；
深度测序：20M reads