服务简介

一、生物信息分析

1.原始数据整理、过滤及质量评估

2. 基因组序列拼装与分析：

     ♦基因组序列拼装

     ♦基因组拼装效果评估 (Contig N50、Scaffold N50、基因组大小和GC含量 )

3. 功能元件分析：

     ♦蛋白编码基因预测

     ♦非编码RNA预测

     ♦蛋白编码基因的功能注释

     ♦蛋白编码基因的KOG和GO注释

     ♦蛋白编码基因的代谢途径注释（KEGG pathway）  

4. 根据客户要求进行个性化分析

二、样品要求

1、DNA样品：Miseq DNA PE文库浓度≥20ng/µl，总量≥6µg（荧光定量）；Miseq DNA MP文库浓度≥40 ng/μl，总量≥12 μg（荧光定量）；454 DNA库浓度≥20 ng/μl，总量≥3 μg（荧光定量），电泳检测无明显RNA条带，基因组条带清晰、完整，主带应在100 kb以上。若样品中有多糖、糖蛋白的残留，对打断DNA样品带来非常大的困难，且很难去除，因此特别要求所提供的样品不要有多糖或糖蛋白污染。

2、动物样品：对于一般物种应挑选肝脏、肾脏、血液等组织取样，对于珍贵物种请提供耳样、毛发（带毛根）等脂肪含量较少的组织进行取样。为了减少个体差异对后续拼接产生的影响，尽量从同一个个体中取样。若物种体积较小，从一个个体中提取的DNA量不能满足测序实验所需，在保证量的前提下，应尽量减少采样个体的数量。提供组织样品应＞500 mg，尽量提供较多量，不同的物种DNA提取产量有差异。

3、植物样品：植物材料应尽量选取植物组织幼嫩部位。提供组织样品应＞500 mg，尽量提供较多量，不同的物种DNA提取产量有差异。

三、测序平台

Illumina MiSeq数据为主，结合Illumina HiSeq2000数据