服务简介

一、生物信息分析

1. 原始数据整理、过滤及质量评估

2. 基因组重测序分析：

♦与参考基因组比对（共线性）

♦SNPs和InDel的检测及在基因组的分布

♦CNV和SV的检测及在基因组的分布

♦包含变异基因的COG和GO分析

二、样品要求

1、细菌：Miseq DNA PE 文库浓度≥20 ng/ μl，总量≥6 μg（荧光定量）；Miseq DNA MP 文库浓度≥40 ng/ μl，总量≥12 μg（荧光定量）；454 DNA库浓度≥20 ng/ μl，总量≥3 μg（荧光定量）。电泳检测无明显RNA条带，基因组条带清晰、完整，主带应在100 kb以上，DNA无降解，无污染。提供菌粉＞1g，菌液＞5 ml，尽量提供较多量，不同的物种DNA提取产量有差异。

2、真菌：Miseq DNA PE 文库浓度≥20 ng/ μl，总量≥6 μg（荧光定量）；Miseq DNA MP 文库浓度≥40 ng/ μl，总量≥12 μg（荧光定量）；454 DNA库浓度≥20 ng/ μl，总量≥3 μg（荧光定量）。提供组织样品应＞1 g，尽量提供较多量，不同的物种DNA提取产量有差异。

3、样品保存期间切忌反复冻融。

4、送样管务必标清样品编号，管口使用Parafilm膜密封。

5、提供DNA电泳检测照片，用自封袋密封后随样品一起送样。

三、测序平台

 Illumina MiSeq、Illumina HiSeq2000