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地 址:上海
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服务简介
一、生物信息分析
1. 原始数据整理、过滤及质量评估
2. 参考基因组注释信息整理
3. 比对到参考基因组及结果评估
3.1 外显子测序深度分布分析
3.2 外显子测序均一性分析
4. SNP分析
4.1 SNP检测
4.2 SNP注释
5.插入和缺失(InDel)分析
5.1 InDel检测
5.2 InDel注释
6. 编码序列突变及氨基酸取代预测
7. dbSNP数据统计及疾病分析
二、样品需求
1. 基因组DNA:Illumina:DNA浓度≥20 ng/μl,总量≥6 μg;Ion proton:DNA浓度≥20 ng/μl,总量≥300 ng,OD 260/280介于1.8-2.0之间,电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整。样品浓度越高越好。
2. 血液样品:请使用专业抗凝管储存样品。哺乳动物血液提供>2ml,有细胞核的血液>500ul。
3. 样品中有多糖、糖蛋白的残留,往往对打断DNA样品带来非常大的麻烦,且很难去除,因此特别要求,客户提供的样品一定要将多糖或糖蛋白去除干净。
4. 样品保存期间切忌反复冻融。
三、测序平台
Ion Proton、Hiseq2500平台
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