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地 址:上海
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服务简介
一、生物信息分析
1. 原始数据整理、过滤及质量评估
2. ChIP-Seq序列与参考基因组序列的比对
3. Peak Calling(统计每个样品的Peak片段信息)
4. Peak Annotation(根据已有的基因组数据库注释信息获得所有Peak位点信息)
5. Motif预测、基因集分析
6. 全基因组范围的峰值分布
7. 样品间差异Peak分析
8. 基因组水平和感兴趣区域的数据可视化
二、样品要求
1、质量要求:ChIP DNA OD 260/280应在1.8至2.0之间。DNA片段大小在100-500 bp范围内,主带明显,建议在250 bp左右,同时请提供DNA打断时的检测胶图。样品最好经过ChIP-PCR验证。
2、浓度要求:样品量≥60 ng,浓度≥200 pg/μl。若单次ChIP后DNA量不够,建议将2-3次ChIP的DNA合并在一起。
3、样品包装:样品溶于超纯水中,放于DNase-free的1.5 ml离心管中,管口用封口膜封好。请在样品管上做好清楚的标识,最好写在标签纸上,贴在管壁。
4、样品信息:请仔细填写样品信息表,并且请同时提供质量检测相关数据和图片,包括分光光度、电泳胶图或Nanodrop仪器检测数据等。同样品一起送样。
5、样品运输:DNA样品请用干冰或者冰袋运输。干冰运输时间不要超过72小时;冰袋运输,时间最好不要超过24小时。
三、测序平台
Ilumina HiSeq2000、 Ion Proton
服务详情