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真核有参转录组测序分析仅需1500元

  • 转录组测序
  • 转录组数据分析
  • 转录组生物信息分析

价格: 1,500元/样品

地址:北京

周期:21天

服务简介

转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。在自然界生物的中心法则中,转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带,是生物体内最重要的一个调控环节,高通量的转录组测序技术,可以同时获得序列数据和表达数据,利用转录组测序得到的变异信息和表达信息,可以全面直观的对某种生物性状进行研究,找出潜在基因,潜在位点,以及调控路径。

服务详情


真核有参WAP端Banner.jpg


转录组测序技术优势

1. 直接得到核酸序列信息,除了得到基因表达量的差异,更可以检测RNA的结构和结构变异。 
2. 开放性高,可以检测多种转录本,在测序覆盖率足够大时能够检测到细胞中的低丰度转录本。 
3. 随着测序深度的增加可以获得更广的动态检测范围,能够同时鉴定和定量高丰度转录本和低丰度转录本。

 

转录组测序实验技术路线


转录组1.png


RNA送样要求

总量需求

文库类型

测序平台

测序数据量

浓度≥100 ng/μL

总量≥2 μg

 

Oligo(dT)富集mRNA建库

Illumina PE150

6G raw data


组织样品送样要求

总量需求

文库类型

测序平台

测序数据量

总量≥200 mg

 

Oligo(dT)富集mRNA建库

Illumina PE150

6G raw data


转录组生物信息分析技术路线

分析内容:


转录组图片2.png


1 有参转录组的生物信息分析列表


产品分类

标准分析内容


常规转录组产品(mRNA)

数据产出统计及质量控制

与基因组比对和统计

表达量计算和差异分析

差异基因聚类分析

GO分布统计和富集分析

KEGG注释和富集分析

新转录本分析

IPA网络分析

cSNPs分析

蛋白互作分析


分析结果展示:

1.基因组比对情况统计:

sample

gp1.1

gp1.2

gp2.1

gp2.2

mapped reads

63282267

74502312

66226568

69423175

read 1

31638078 (0.5)

37256722 (0.5001)

33106246 (0.4999)

34724085 (0.5002)

read 2

31644189 (0.5)

37245590 (0.4999)

33120322 (0.5001)

34699090 (0.4998)

paired reads

59275142 (0.9367)

69531652 (0.9333)

62156714 (0.9385)

65541378 (0.9441)

single mapped reads

4007125 (0.0633)

4970660 (0.0667)

4069854 (0.0615)

3881797 (0.0559)

properly mapped reads

45102278 (0.7127)

52023648 (0.6983)

45556729 (0.6879)

44982659 (0.6479)


1 reads比对到参考基因组的比率统计

转录组2.png



2. 样品间聚类情况分析:


样品间聚类分析3.png

3.差异基因分析:


差异基因表达2.png



差异基因表达3.png



差异功能及通路分析:



WEGO.png

KEGG通路分析.png

图片1.png



联系电话:15210214892

联系人:孙老师



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