服务简介

实验流程

实验流程分为三步，建立谱图库、DIA数据采集、DIA数据定量分析。
1.使用胰蛋白酶对各个样本相同的蛋白量进行酶解，酶解后的肽段混合物中加入稳定重同位素标记的肽段，使用LC-MS/MS以及DDA数据采集模式对其进行分析，检测得到的结果使用软件进行检索分析。软件根据MS2谱图的信息，并结合经典的正反库搜库策略对MS2谱图进行解析，并得到肽段鉴定结果，进而得到蛋白质鉴定结果，将该鉴定结果构建为谱图库；
2.随后各个样本进样相同量的蛋白酶解后的肽段进入LC-MS/MS进行检测，使用DIA采集策略对各个样本进行数据采集；
3.使用DIA数据处理软件，根据样本中掺入的稳定重同位素标记肽段的色谱保留时间对各个样本鉴定到的谱图信息进行保留时间校正，然后根据谱图库中蛋白质鉴定到的多肽信息在DIA数据中进行定量离子信号抽提，统计其色谱峰面积，最后对各个样本间的蛋白质丰度进行比较。

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样品要求

1.各个样本蛋白质总量在100ug以上；

2. 样本来源：体液样本，组织样本，植物样本，微生物样本。。。

3.溶液样本须告知详细的溶液组成；
4.请使用足量的干冰运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。

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交付结果

1.实验流程；
2.前处理基本方法；
3.LC-MS/MS参数；
4.蛋白质定性、定量结果列表；
5.差异蛋白筛选列表；
6.生物信息学分析：GO注释，KEGG通路分析、蛋白质相互作用网络图分析。