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转录组测序+数据分析

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  • Illumina高通量测序

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服务简介

实验流程


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样品要求

有参转录组测序

1. 样品类型:完整且无污染的总RNA;

2. 样品需求量(单次):200 ng; 2ug(真菌);

3. 样品浓度:≥20ng/μL;≥40ng/μL(真菌);

4. 样品纯度:28S:18S≥1.0;RIN≥7.0(动物);RIN≥6.5(植物&真菌);昆虫样品无28S:18S及RIN值要求;

5. 样品OD值: 260/280≥1;260/230≥1.8;昆虫和动物样品无OD值要求。

测序深度

1. 有参真核普通转录组4 Gb数据量;极大基因组,如小麦、玉米等8 Gb数据量;如要做基因融合等信息分析,建议 8Gb 数据量以上,Illumina HiSeq,PE100或PE150,常规转录组文库或链特异性全谱转录组文库

2. 有参原核普通转录组1 Gb数据量,Illumina HiSeq,PE100或PE150,常规转录组文库或链特异性全谱转录组文库

     注:可根据老师研究目的进行更高深度测序

无参转录组测序

1. 样品类型:完整且无污染的总RNA;

2. 样品浓度:≥20ng/μL;≥40ng/μL;

3. 样品纯度:28S:18S≥1.0;RIN≥7.0(动物);RIN≥6.5(植物&真菌);昆虫样品无28S:18S及RIN值要求;

样品OD值: 260/280≥1;260/230≥1.8;昆虫和动物样品无OD值要求。

测序深度

1. 无参真核普通转录组4 Gb数据量;极大基因组,如小麦、玉米等8 Gb数据量;如要做基因融合等信息分析,建议 8Gb 数据量以上,Illumina HiSeq,PE100或PE150,常规转录组文库或链特异性全谱转录组文库

2. 无参原核普通转录组1 Gb数据量,Illumina HiSeq,PE100或PE150,常规转录组文库或链特异性全谱转录组文库

     注:可根据老师研究目的进行更高深度测序

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