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ChIP-seq+数据分析

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  • 数据分析
  • 基因芯片、高通量测序、qPCR、West
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  • 高通量检测
  • 高通量二代测序
  • 生物信息学分析

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地 址:北京

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服务简介

ChIP-seq 产品介绍

 

ChIP-seq技术(染色质免疫共沉淀技术)能特异性地富集与目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行高通量测序分析。ChIP-seq技术是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,能够高效地在全基因组范围内在单碱基水平上检测出与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段,是研究基因表达调控的有力工具之一。

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实验流程


图片9.png

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样品要求


样本要求

1. 样品类型:ChIP富集好的DNA样品;

2. 组织类型:不限 ;

3. 物种信息:不限 (有基因组参考序列) ;

4. 抗体类型:不限(需提供ChIP阳性位点或所用抗体的信息,用于样品质检和测序数据分析。)

5. 样本保存和运输要求:-20°C保存,冰袋运输;

6. 样品总量:单次实验≥200 ng,请尽可能提供两次以上的用量;

7. 样品浓度:≥10 ng/µL;

8. 样品纯度:OD260/OD280 = 1.8-2.2;

9. DNA片段大小:分布在100-500 bp,主峰分布在200-300 bp;

10. 建议提供ChIP获得DNA设计引物进行qPCR定量的检测报告,附阳性和阴性对照的结果。

测序深度

1)常规深度:6G clean data;高深度:10G clean data,Hiseq 2×150

注:可根据老师研究目的进行更高深度测序

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交付结果


分析报告

服务详情

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