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宏基因组测序+数据分析

  • 生物信息分析
  • 宏基因组测序
  • 数据分析
  • 基因芯片、高通量测序、qPCR、West
  • 高通量

价格: 面议

地 址:北京

周 期:40~70个工作日

服务简介

宏基因组测序简介 宏基因组(Metagenomics)是指特定条件下特定环境中全部微小生物遗传物质的总和,它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因, 目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。宏基因组测序利用高通量测序技术,不要求对每个微生物进行分离纯化培养,而是直接从样品中提取基因组DNA后进行测序分析。通过宏基因组测序,能够解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系,极大地扩展了微生物学研究范围。

服务详情

实验流程

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样品要求


1. DNA样本:

1) 样本要求:DNA总量≥5μg(或50ng cDNA片段,片段长度200-500bp),建议一次性提供至少两次的制备量;DNA浓度≥50ng/μl;OD260/280=1.8~2.0;无蛋白质、RNA或肉眼可见杂质污染

2) 样本保存及运输:请选择干粉、酒精、TE buffer或超纯水一种保存,并在样品信息单中注明(样本保存期间切忌反复冻融)。

2. 环境样本:

1) 采样后务必立即封存样品(冷冻保存,推荐液氮处理),土壤、粪便、污泥、海水沉积物等样品>3g,植物树枝叶片、堆肥等>100g;

3. 测序策略:小于800bp小片段文库,HiSeq4000,PE150测序

4. 指标:每个样品,至少完成 1Gb Clean data;哺乳动物肠道样本建议 4-5Gb/样;复杂环境(如海洋、土壤等)数据量建议增加到 8-10G/样本;HiSeq4000,PE150测序

5. 项目周期:40-70个工作日

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交付结果


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