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Miseq基因组微生物分类测序

  • 微生物多样性检测

价格: 580元/样品

地 址:上海

周 期:2周

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服务简介

微生物分类测序 :

Illumina MiSeq测序读长达到2×300bp后,对于微生物分类和特定扩增子测序的应用形成了极高的性价比。适用于细菌、真菌、古菌、微藻类、各功能基因(如硝化/反硝化基因、固氮基因、氨氧化基因、厌氧氨氧化基因等等)以及其他客户定制性片段不超过500bp的DNA多样性片段;
生工生物在该领域积累了大量实验及分析经验,经过不断的实验优化以及分析模块的开发,可以为广大科研用户提供从基因组提取到数据分析一站式服务!

项目实验流程:

基因组提取
PCR区域扩增
回收并定量
MiSeq 2X300 测序

生工生物实验优势:

1. 生工生物有丰富的样品处理经验,包括海洋环境(水、沉泥)、土壤、污水、植物内生菌、空气滤膜、肠道、发酵罐等含有微生物的样本;
2. 生工生物有效的将扩增实验与文库构建融合,减少PCR偏差;
3. 生工生物拥有大量带barcode引物,省去合成引物的费用,包括16s:V1-V3,V3-V4,V4-V5,V6-V8;ITS:ITS1-ITS2,ITS3-ITS4;
   18s:V4,NS1-Fung等可变区;
4. 可指导客户根据设计的引物体系自行完成实验处理,由生工进行测序与分析,省钱省事。

项目分析流程:

分析展示图:

生工生物分析优势:

1.分析内容全面,解析详细;
2.没有所谓高级分析,只要是流程之内的,全部算标准分析,不会额外产生费用;(详细分析内容请通过技术支持索取分析示例)
3.项目完结时间快,40天即可交付报告;

价格体系:

样品数目n(单位/PCR产物个数)价格说明
≤30780测序平均4万条序列
31≤n≤100680同上
n≥101580同上
更多询价同上

样本要求:

A、DNA样品:

1. 请提供提取DNA所用的相关试剂盒信息,土壤类样品建议采用MoBio或OMEGA土壤提取试剂盒。
2. DNA要求:因为很多来源的样品有各类杂质污染,紫外检测准确度不高;
   因此需要Qubit2.0检测结果大于10ng/ul或者琼脂糖电泳检测能看到基因组条带即可。
3. 如有条件,可用相关类群的通用引物(例如细菌341F,805R)进行预扩增检测。

B、原始样品:

1. 土壤/淤泥等样品量大时需要用密封袋或其他大容器单独包装,少量用12.0EP管装并用封口膜封口,尽量提供1g以上土壤;
粪便以及口腔类样品用12.0EP管装并用封口膜封口;污水请用干净的塑料瓶提供;
2. 生工按照不同样品选择合适的提取试剂盒,如有指定试剂盒,请提供相应信息或者试剂盒。

其他测序业务

1. RNA测序服务

A. 去掉tRNA,rRNA等后的RNA测序服务
   将总RNA中tRNA,rRNA去掉,再进行RNA测序,包含总mRNA、noncodingRNA信息。
B. 常规转录组测序
   将总RNA中mRNA富集,再进行RNA测序,适合做mRNA研究一般需要5G数据。

2. DNA测序服务

A. 基因组水平微卫星标记寻找
   未知遗传信息的物种,对基因组进行测序,寻找可利用的微卫星标记信息
B. 核酸适配体测序
   采用高通量测序技术,对核酸适配体深度测序,获得核酸适配体的序列构成以及丰度信息
C. BAC-叶绿体-质粒-病毒等小基因组测序
   构建短片段文库,Miseq 2x300bp测序,达到精细图标准,多数项目均可达到全图标准

3. 扩增子测序

利用多重扩增技术,针对客户提供的基因进行外显子区域的引物设计与合成,可以一次性对上百种基因的数百数千个外显子进行测序


服务详情

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