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全基因组甲基化测序

  • 全基因组甲基化测序

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服务简介

全基因组甲基化测序技术原理


     WGBS(Whole-genome bisulfite sequencing)被视为甲基化测序的“金标准”。其原理是用Bisulfite处理,将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U,进行PCR扩增后变成T,与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来,再结合高通量测序技术,与参考序列比对,即可判断CpG/CHG/CHH位点是否发生甲基化,特别适用于绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。

技术优势


成熟的实验流程:具有丰富的样品处理经验和建库经验
严格的质控标准:可以提供整套质控分析,确保数据准确性
丰富的数据分析内容:专业的生物信息分析团队,综合解析WGBS数据,与客户交流,提供个性化分析

完善的售后服务:提供全面的数据和图形内容,同时技术人员提供面对面结果讲解和不限次的电话反馈。

推荐测序模式


● 测序平台:Hiseq X Ten
● 测序类型:PE50
● 测序深度:30 X (或 50 X

全基因组甲基化研究思路


    全基因组甲基化测序不但可使研究者在基因组规模洞察不同生物之间在DNA 甲基化水平和模式上的差异, 也可用于研究同一物种多个样品间的差异性甲基化区域(differentially methylated regions DMRs)。同时,基因组的甲基化状态具有一定的时空特异性。对某一物种,不同的环境、不同的发育阶段、不同类型的样品(细胞、组织、个体)所反映的甲基化状态可能是不同的,存在着差异性甲基化区域。其中有些是与基因调控有关的功能区域。鉴定、分析这些区域及其所在的基因或CpG岛,对发育和肿瘤等生命过程研究有一定意义。

说明: F:中康博微信订阅号技术服务篇全基因组甲基化测序全基因组甲基化测序研究思路.png

全基因组甲基化测序项目流程



 
全基因组甲基化测序分析流程


 

说明: F:中康博微信订阅号技术服务篇全基因组甲基化测序全基因组甲基化测序数据分析流程.png

 

全基因组甲基化测序样品要求(基因组DNA)


   样品纯度:OD 260/280值应在1.8~2.0 之间; RNA 应去除干净;
   样品浓度:最低浓度不低于50ng/µl;
   样品总量:每个样品总量不少于500 ng;
   样品溶剂:应溶解在H20或TE (pH 8.0)中;
   样品运输:DNA低温运输(-20℃);在运输过程中将管口密封好,以防出现污染。


服务详情

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