服务简介
一、背景介绍
应用于生物医学研究领域的哺乳动物细胞被错误鉴定和交叉污染的问题,一直是一个普遍存在的突出问题。据统计,国外实验室有20%左右的细胞株被错误鉴定和交叉污染,NIH和ATCC近两年都对此发出呼吁,要求研究者对细胞进行鉴定。
近年来,大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一,STR基因分型应用于细胞鉴定已被ATCC等机构强烈推荐。
阅微基因在国内已率先推出了细胞STR鉴定服务并与多家研究机构、细胞中心、生产厂商等建立长期合作关系。
高度丰富信息:同时分析多个STR基因座,可以准确的判断交叉污染和细胞类型。
高度灵敏:可以检测最低0.1ng DNA(约15个二倍体基因组),微量样本即可满足需求,并且可以检测到早期污染。
高通量和系统化平台:采用自动化分析系统可大量检测及数据分析,结果更加准确、客观。
二、细胞STR鉴定的必要性
在过去的45 人类乳突状瘤病毒(人类乳头状瘤病毒18或HPV18)转型成癌细胞的,而且和正常子宫颈细胞有许多不同。 据估计,国外实验室已建株细胞有接近20%存在上述问题。
2008年,约瑟芬Nefkens研究所的分子生物学家Winand13株食管腺癌细胞系中,其中3株:SEG-1,BIC-1和SK-GT-5被污染,这些细胞株混合有其他癌细胞。这些细胞系已经被多家实验室应用在两个临床试验、并发表了超过100篇SCI文章,并申请了11个美国专利,这一研究结果被发布在最新一期的Journal of the National Cancer Institute(JNCI)。
2007 年NIH发布了通知,强烈建议在使用培养细胞的时候进行鉴(authentication)。2008 年底,专家提议ATCC致力于人源细胞系的鉴定工作,并制定鉴定的标准程序。
近年来,大量研究表明STR 基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一,STR基因分型应用于细胞鉴定已被ATCC等机构强烈推荐。美国的ATCC 细胞库、德国的DSMZ细胞库以及日本的JCRB细胞库等为STR 分型提供了各细胞株的数据供比对。
2011年初,美国菌种保藏中心(ATCC)制定了人源细胞系STR鉴定标准,旨在约束因细胞交叉污染和错误辨识所导致的无效科研数据的不断扩增。更重要的是,细胞系的精确鉴定在研发基于细胞下的医学产品时起到至关重要的作用,它能避免将人体细胞暴露于错误鉴定细胞中的风险。
三、服务项目:
1.人类细胞20个基因座检测
目前基因座最多的检测服务,所选用的基因座不仅包含ATCC和JCRB细胞库中的基因座,更添加11个高度多态性位点,可方便与权威数据库进行比对,具有极高的准确性。位点如下:
D5S818 | D13S317 | D7S820 | D16S539 | vWA |
TH01 | AMEL | TP0X | CSF1P0 | D19S433 |
FGA | D18S51 | D21S11 | D8S1179 | Penta E |
D3S1358 | Penta D | D6S1043 | D12S391 | D2S1338 |
2.小鼠细胞检测
利用阅微基因专利产品分析小鼠基因组中8个高度多态性位:D1Mit159.1、D2Mit395.1、D4Mit170.1、D7Mit40、D11Mit4、D15Mit16、D17Mit51.1和Jarid1。
3.人鼠细胞交叉污染检测
国内首创技术,采用人鼠复合扩增体系检测人类细胞中的小鼠细胞污染,主要应用在干细胞研究领域。同时可以用于判断人鼠细胞混淆的情况。
四、技术路线:
五、技术优势:
阅微基因是最早做细胞STR鉴定,长期与药监局下属的检定院合作;
经验丰富,几年的工作中我们积累了大量的数据和资料;我们还独立开发了小鼠 的鉴定体系,这是全球首个用于小鼠的鉴定体系,得到国内外的广泛认可。
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