服务简介

一、生物信息分析

1、原始数据整理、过滤及质量评估

2、划分OTU分类地位鉴定

3、à多样性分析

    ♦Rarefaction稀疏曲线

    ♦Specaccum物种累积曲线

    ♦丰度等级曲线

    ♦Alpha多样性指数计算

4、ß多样性分析

    ♦PCA分析

    ♦UniFrac-PCoA分析

    ♦UniFrac-MDS分析

    ♦UniFrac-UPGMA聚类分析

    ♦基于UniFrac距离的多组比较和箱线图展示

5、群落组成交互式可视化

    ♦多样本共有OTU的Venn图分析

    ♦三元相图分析

    ♦系统发育树构建

    ♦MEGAN可视化展示

    ♦GraPhlAn可视化展示

    ♦Krona交互式展示

    ♦ 热图分析

6、多组样本差异分析

    ♦me tastats分析

    ♦LEfSe分析

    ♦Wilcoxon秩和检验

    ♦Welch’s t检验

    ♦Fisher’s精确检验

    ♦ANOVA方差分析

7、约束排序/机器学习

    ♦RDA分析

    ♦CAP分析

    ♦PLS-DA分析

    ♦Adonis/PERMANOVA分析

    ♦ANOSIM分析

    ♦随机森林分析

8、网络分析

    ♦优势微生物类群的关联网络

    ♦OTU—样本二分网络

9、群落代谢功能预测

10、根据客户需求进行个性化分析

二、样品需求

1、样品采集：样品采集条件的一致是最为重要的环节，严格按照采样标准采样，采样后立即封存样品冷冻保存。

2、样品DNA：环境因素异常复杂，许多物质或抑制因子影响后续PCR、测序文库构建和序列测定，常规提取方法不一定适合，建议采用专用试剂盒提取。提供浓度≥20 ng/μl，总量≥500 ng的基因组DNA，并确保电泳检测无明显RNA条带，基因组条带清晰、完整；基因组DNA完全无降解；提供DNA电泳检测照片，用自封袋密封后随样品一起送样。组织样品＞1.5 g。

 3、样品保存期间切忌反复冻融。

 4、送样管务必标清样品编号，管口使用Parafilm膜密封。

三、测序平台

PacBio