实验流程------------------样本前处理高分辨率数据采集软件分析,定性定量分析样品要求------------------具体样本具体商议样本需低温寄送交付结果------------------ 1.化合物鉴定结果 2.主成分分析(PCA) 3.多维统计分析图 4.差异化合物筛选结果 5.差异代谢物聚类分析 6.差异代谢物KEGG通路分析
样品要求--------------样本纯度需要在95%以上,蛋白总量在10ug左右。我们可以对以下几种样本进行分析:冻干样本,PVDF膜和溶液样品。 PVDF膜类样品的准备过程1.样品电泳和电转(1)对蛋白样品进行1D或者2D跑胶(2)将蛋白胶上的样品转移至PVDF膜上;注意:不要使用硝酸纤维素膜(Nitrocellulose membranes)(3)在此过程中请佩戴手套和头套,避免自身角蛋白对测序结果的影响2.PVDF膜的染色(1)染色过程中可以使用考马斯亮蓝或者立春红对PVDF膜进行染色;注意:千万不要使用银染的方法进行染色(2)染色完成之后,可以使用双蒸水对PVDF膜进行清洗(3)如果转膜的缓冲液中含有甘氨酸,需要对PVDF膜进行多次冲洗,以避免甘氨酸对后续分析的影响(4)更详细的样品准备步骤与,见Edman测序样品准备Protocol3.靶蛋白条带获取(1)PVDF膜染色后,靶条带清晰可见,用洁净的解剖刀将靶蛋白条带切下(2)在蛋白量允许的情况下,可以准备2-3条靶条带以增加靶蛋白的量4.样品运输(1)密闭包装后,冰袋运输即可交付结果-------------- N端测序结果
实验流程------------ 1.蛋白质酶解; 2.质谱检测; 3.数据分析。------------------------------------------------样品要求------------ 蛋白纯度要求在90%以上,具体项目具体讨论; 蛋白总量在20ug以上,具体项目具体讨论; 样本需低温运输。------------------------------------------------交付结果------------- 1.括实验流程; 2.前处理基本方法 3.LC-MS/MS参数 4.N端C端鉴定结果列表
实验流程----------- 1.蛋白质酶解; 2.质谱数据深度采集; 3.数据检索分析;------------------------------------------------样品要求----------- 蛋白质总量在100ug以上; 如是液体样本需要告知其溶液组成; 样本需低温邮寄。------------------------------------------------交付结果----------- 1.实验流程; 2.前处理基本方法 3.LC-MS/MS参数 4.蛋白质鉴定结果列表
实验流程------------- 1.蛋白质还原与非还原状态下酶解; 2.质谱数据采集; 3.Byonic与Byologic软件数据分析。------------------------------------------------样品要求-------------- 1.如果是单个蛋白质,纯度要高,具体样本具体分析; 2.要求提供蛋白质相关信息; 3.样本低温运输。------------------------------------------------交付结果-------------- 1.氨基酸序列匹配结果; 2.二硫键匹配结果。