微生物分类测序 :Illumina MiSeq测序读长达到2×300bp后,对于微生物分类和特定扩增子测序的应用形成了极高的性价比。适用于细菌、真菌、古菌、微藻类、各功能基因(如硝化/反硝化基因、固氮基因、氨氧化基因、厌氧氨氧化基因等等)以及其他客户定制性片段不超过500bp的DNA多样性片段;生工生物在该领域积累了大量实验及分析经验,经过不断的实验优化以及分析模块的开发,可以为广大科研用户提供从基因组提取到数据分析一站式服务!项目实验流程:基因组提取PCR区域扩增回收并定量MiSeq 2X300 测序生工生物实验优势:1. 生工生物有丰富的样品处理经验,包括海洋环境(水、沉泥)、土壤、污水、植物内生菌、空气滤膜、肠道、发酵罐等含有微生物的样本;2. 生工生物有效的将扩增实验与文库构建融合,减少PCR偏差;3. 生工生物拥有大量带barcode引物,省去合成引物的费用,包括16s:V1-V3,V3-V4,V4-V5,V6-V8;ITS:ITS1-ITS2,ITS3-ITS4; 18s:V4,NS1-Fung等可变区;4. 可指导客户根据设计的引物体系自行完成实验处理,由生工进行测序与分析,省钱省事。项目分析流程:分析展示图:生工生物分析优势:1.分析内容全面,解析详细;2.没有所谓高级分析,只要是流程之内的,全部算标准分析,不会额外产生费用;(详细分析内容请通过技术支持索取分析示例)3.项目完结时间快,40天即可交付报告;价格体系:样品数目n(单位/PCR产物个数)价格说明≤30780测序平均4万条序列31≤n≤100680同上n≥101580同上更多询价同上样本要求:A、DNA样品:1. 请提供提取DNA所用的相关试剂盒信息,土壤类样品建议采用MoBio或OMEGA土壤提取试剂盒。2. DNA要求:因为很多来源的样品有各类杂质污染,紫外检测准确度不高; 因此需要Qubit2.0检测结果大于10ng/ul或者琼脂糖电泳检测能看到基因组条带即可。3. 如有条件,可用相关类群的通用引物(例如细菌341F,805R)进行预扩增检测。B、原始样品:1. 土壤/淤泥等样品量大时需要用密封袋或其他大容器单独包装,少量用12.0EP管装并用封口膜封口,尽量提供1g以上土壤;粪便以及口腔类样品用12.0EP管装并用封口膜封口;污水请用干净的塑料瓶提供;2. 生工按照不同样品选择合适的提取试剂盒,如有指定试剂盒,请提供相应信息或者试剂盒。其他测序业务1. RNA测序服务A. 去掉tRNA,rRNA等后的RNA测序服务 将总RNA中tRNA,rRNA去掉,再进行RNA测序,包含总mRNA、noncodingRNA信息。B. 常规转录组测序 将总RNA中mRNA富集,再进行RNA测序,适合做mRNA研究一般需要5G数据。2. DNA测序服务A. 基因组水平微卫星标记寻找 未知遗传信息的物种,对基因组进行测序,寻找可利用的微卫星标记信息B. 核酸适配体测序 采用高通量测序技术,对核酸适配体深度测序,获得核酸适配体的序列构成以及丰度信息C. BAC-叶绿体-质粒-病毒等小基因组测序 构建短片段文库,Miseq 2x300bp测序,达到精细图标准,多数项目均可达到全图标准3. 扩增子测序利用多重扩增技术,针对客户提供的基因进行外显子区域的引物设计与合成,可以一次性对上百种基因的数百数千个外显子进行测序
免疫印迹技术原理Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测的方法。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。购买生工生物Western Blot 委托实验服务的客户,将享受798元/膜的促销特价,除此之外,您还可以获得下列优惠:预实验免费二抗及内参抗体免费选用生工自产BBI品牌一抗,享受5折特价优惠单笔订单慢3000元,赠生工定制版净水壶一只一、服务内容1、从动物、植物细胞或组织等样品中提取蛋白,也可以是重组蛋白、血清、培养上清等样品(提取费50元/样)2、对样品中蛋白进行半定量分析3、Western blot检测(1) 电泳:聚丙烯酰胺凝胶(SDS-PAGE)分离蛋白样品(2) 湿法转印(BLOTING:Tank Transfer)(3) 杂交:用抗体鉴定膜上的特定蛋白(INCUBATION: Antibody)(4) 化学发光检测(ECL),胶片曝光4、预实验及正式实验服务:帮助客户设计样品上样顺序以符合论文发表要求5、免费进行蛋白内参检测(本公司的内参抗体均免费提供)二、样品要求1、细胞>1×107;组织>30mg;细菌湿重>1mg;植物>100mg;血清>50ul等2、样品蛋白浓度>1mg/ml,蛋白量>200ug/样品三、客户提供材料1、新鲜或正确保存的样品(按照我们的要求提供)2、目的蛋白一抗:我们可以给客户免费提供抗体查找服务3、阳性对照样品(可选)4、相关文献(可选)四、提交给客户结果1、预实验曝光结果(胶片及扫描图)2、正式实验曝光结果(胶片及扫描图)3、完整实验报告 五、结果展示六、免疫印迹服务报价 798元/膜
代谢物作为生物体表型的基础能够帮助我们更直观有效地了解生命现象揭示生命本质。代谢组学本质上是指从整体上研究生物体的代谢物,是对某一生物、组织或细胞中的所有低分子量代谢产物进行定性与定量分析的一门科学。代谢组学以指标分析为基础,高通量检测为手段,通过研究生物体内代谢物的种类与数量及其变化规律来阐述机体在正常生命状态及环境变化后的代谢过程。代谢组是系统生物学的分支学科之一。目前,其研究内容主要包括对代谢物进行定性或定量分析,不同基因型的生物体进行代谢组学表型研究,不同生长环境及加物理、化学或生物性刺激后个体代谢产物的应答,进行代谢途径或代谢网络解析与转基因评价。主要流程非靶向代谢组学分析:样品预处理LCMS或GCMS上机实验图谱预处理多元数据分析差异代谢物筛选及定性聚类分析韦恩图分析靶向代谢组学分析:标准溶液的配制样品的前处理质量控制与质量保证色谱图分析及标准曲线的建立靶向物质的计算订购信息项目名称内容服务周期价格非靶向代谢组学分析样品组的差异代谢物的定性分析和相对定量8-12个工作周询价靶向代谢组学分析样品的靶向代谢物绝对浓度的测定8-12个工作周询价客户提供提供样品微生物、细胞样本,动物体液(如尿、血、组织、器官、唾液),植物样本,血清样品,尿液样品等;下载并填写 《非靶向代谢组学服务订购表_V1.0》 《靶向代谢组学服务订购表_V1.0》最终交付交付报告总离子流色谱图;数据矩阵;多元统计分析;差异代谢物筛选;常规生物信息学分析;聚类热图分析。
iTRAQ是目前运用最广泛的一种标记定量蛋白质组技术,通过与氨基酸末端氨基以及赖氨酸残基的游离氨基结合,实现对多肽的标记,并通过不同分子量的试剂对不同来源样品进行标记的方式实现不同样品间蛋白质组比较的目的。iTRAQ试剂结构由指示基团、中性平衡基团和反应基团三部分组成。不同指示基团及其相对应平衡基团的质量和都相同,而反应基团能与赖氨酸ε氨基和所有肽链的氨基末端连接,可标记所有氨基酸。不同标记试剂与来源于不同样品胰酶消化后的肽段结合,经过色谱分离,并通过一级质谱和二级质谱。平衡基团在二级质谱时发生中性丢失,而报告基团在二级质谱低质量区域产生多个报告离子,其信号强度分别代表该标记样品的表达量,根据报告离子的峰面积计算同一蛋白质同一肽段在不同样品间的比值,从而实现蛋白的相对和绝对定量。主要流程蛋白提取定量蛋白标记色谱分离和质谱上机数据库检索及差异表达蛋白筛选差异表达蛋白进行经典生物信息学分析订购信息项目名称内容服务周期iTRAQ蛋白相对绝对定量与生物信息学统计6~8周客户提供提供样品蛋白样品、组织、细胞、细菌、体液等,下载并填写《蛋白定量iTRAQ服务登记表-模板》最终交付交付报告蛋白浓度测定结果;SDS-PAGE预实验结果;样品编号对照表;色谱图;蛋白原始检索结果文件;蛋白原始质谱数据文件;iTRAQ results;生物信息学分析材料。
样品要求:1)近紫外:纯度>90%,蛋白量500-600ug,浓度≥1mg/ml2)近紫外:纯度>90%,蛋白量2500-3400ug,浓度≥1mg/ml实验仪器:JASCO 715,JASCO实验原理:圆二色谱扫描就是利用蛋白质的圆二色性及不对称分子对左右圆偏振光吸收的不同来进行结构分析。蛋白质是由氨基酸通过肽键连接而成的具有特定结构的生物大分子。在蛋白质或多肽中主要的光活性集团是肽链骨架中的肽键、芳香氨基酸残基及二硫键等。当平面圆偏振光的吸收不相同,产生吸收差值。由于这种吸收差的存在,造成了偏振光矢量的振幅差,圆偏振光变成了椭圆偏振光,这就是蛋白质的圆二色性。2)紫外线扫描2.1)20mM PB扫描将样品杯用2M HNO3浸泡过夜,去离子水冲洗干净后晾干,加入20mM PB 350μl,按照以上参数进行190-250nm的远紫外扫描并采集数据。2.2)清洗样品杯后晾干,分别加入浓度为0.2mg/ml的样品按照上述参数进行190-250nm的远紫外扫描并采集数据。3)近紫外扫描3.1)20mM PB扫描将样品杯用2M HNO3浸泡过夜,去离子水冲洗干净后晾干,加入20mM PB 1000ul,按照以上参数进行340-250nm的近紫外扫描并采集数据。3.2)清洗样品杯后晾干,分别加入浓度为1mg/ml的样品按照上述参数进行340-250nm的近紫外扫描并采集数据。3.3) 测试样品:在正离子模式下选择线性方法测试样品分子量。4)扫描图谱处理对扫描后的所有图谱用软件Jwstda32进行smoothing处理。