样本要求:1、细胞数量不少于1*107个;2、提取总蛋白的量20-40ug;3、血清和血浆等体积:250ul4、细胞培养上清液:50-1000ul 做实验,找威斯腾!【本平台合作项目】分子诊断、病理诊断、药效学评价、毒理学实验、细胞药筛、动物建模、PDX模型、CRISPR/Cas9基因编辑、病理检测、基因芯片、蛋白组学、代谢组学、高通量测序、ChIP、CO-IP、生物信息学分析、知识产权服务!【全国免费热线】:400-675-6758【电话】 023-65316016,023-65316556【邮箱】 china-western@163.com【官网网址】www.cqwestern.com【地址】 重庆市高新区二郎创业大道高科创业园 D 栋 2 楼
人类基因组由30亿个核苷酸组成,它们携带着人类的遗传信息并决定人体的生理特征。人类基因组序列的0.1%—0.2%在人种、人群和个体之间存在DNA序列的差异,即单核苷酸多态性(SNP,single nucleotide polymorphism)。许多的这些单核苷酸多态性可引起不同的遗传性状,即遗传的多态性(polymorphism),如ABO血型位点标记,白细胞HLA位点标记和个体药物代谢差异等。了解这些DNA序列的差异和单核苷酸多态性以及这些差异所表现的意义将给疾病的预测、诊断、预后和预防带来革命性的变化。威斯腾生物公司为客户提供稳定而优质的Affymetrix SNP分析检测服务,为客户提供芯片杂交、洗涤、扫描和数据分析等服务。同时,我们还利用SBC与南方基因中心的合资子公司南方基因科技有限公司引进的Illumina微珠基因分型分析系统为广大科研工作者提供SNP芯片技术服务。Affymetrix SNP芯片服务 芯片推荐:Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0 芯片介绍:Affymetrix Genome-Wide Human SNP 6.0芯片产品的涵盖超过1,800,000个遗传变异标志物:包括超过906,600个SNP和超过946,000个用于检测拷贝数变化(CNV,Copy Number Variation)的探针:1)482,000个SNPs来自于前代产品500K和SNP5.0芯片;l2)424,000个SNP包括了源来于国际HapMap计划中的标签SNPs,X,Y染色体和线粒体上更具代表性的SNPs,以及来自于重组热点区域和500K芯片设计完成后新加入dbSNP数据库的SNP;l3)202,000个用于检测5,677个已知拷贝数变异区域的探针,这些区域来源于多伦多基因组变异体数据库。该数据库中的每个3,182个非重叠片断区域分别平均用61个探针来检测;l4)744,000个探针平均分配到整个基因组上,用来发现未知的拷贝数变异区域。应用:除了SNP基因分型之外,还能进行CNV研究。从而能够进行Copy-neutral LOH/UPD检测,亲子鉴定,纯合性分析、血缘关系鉴定。 芯片推荐:Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array 芯片介绍:这款芯片与Human SNP 6.0 芯片类似,既包含SNP探针,也包含CNV探针。一共涵盖623,124个SNP位点和916,269个CNV探针。 芯片推荐:Affymetrix GeneChip Rice 44K SNP Genotyping Array芯片介绍:芯片覆盖indica, aus, tropical japonica, temperate japonica, and group V (“aromatic”)多个水稻亚种的44,1000个SNP。芯片特点: 1.全基因组覆盖:每10kb至少包括1个SNP,每个SNP设计12个探针技术重复相关系数R2 > 99%。2.简便的样本:叶组织或抽提的DNA便可快速灵活的对遗传种质进行鉴定和分类。3.从实验样本DNA到数据快速转换。其它物种商品化SNP芯片包括:牛(bovine和buffalo),鸡,水稻,生菜,胡椒,拟南芥,狗和小鼠。 如有其它物种定制需求,请咨询联系我们。SNP芯片操作流程:1. DNA抽提; 2. 样品质检:用琼脂糖凝胶电泳或LAB-ON-CHIP系统对样品DNA进行质量检测和定量; 3. 扩增,标记;4.杂交、洗脱; 5. 图像扫描:用Affymetrix Scanner3000 7G激光共聚焦扫描仪对杂交结束后的芯片进行扫描; 6. 数据处理:确定检出的SNP位点相应的核苷酸。数据分析:1. SNP位点过滤1)Nocall rate>=10%2)最小等位基因频率,Minor allele frequency<0.053)不符合哈维平衡的位点,HWE P value<0.001 的位点2. 频数统计:计算case/control 组中各等位基因和基因型的频率3. 关联分析1)样品群的分层分析2)卡方检验、Fisher精确检验,比较各allele的频率分布在case和control两组中是否具有统计学差异3)卡方检验、Fisher精确检验和Cochran-Armitage趋势检验,比较各基因型频率分布在两组中是否具有统计学差异4. 单倍型分析1)选取包含显著的SNP的区段进行单倍型分析,以进一步定位候选区段2)频率较高的几种单倍型各自的频率,在case/control两组中的分布状况,卡方统计量及p值,判断单倍型与疾病相关性结果提供:1、实验数据:原始数据(cel文件),基因芯片数据总表,SNP位点信息。2、实验文件:SNP芯片实验操作方法。3、实验图像:SNP芯片扫描图(jgp格式),所有样品的质检电泳图。4、质检文件:DNA质检报告,SNP Call rate。样品要求 1. 样品纯度:OD 260/280值应在1.7~2.0 之间;RNA 应该去除干净;不得有其它个体或其它物种的DNA污染。2. 样品浓度:浓度不低于55ng/µl。3. 样品总量:每个样品总量不少于1µg。4.样品运输: 干冰运输;在运输过程中请用parafilm将管口密封好,以防出现污染。 做实验,找威斯腾!【本平台合作项目】分子诊断、病理诊断、药效学评价、毒理学实验、细胞药筛、动物建模、PDX模型、CRISPR/Cas9基因编辑、病理检测、基因芯片、蛋白组学、代谢组学、高通量测序、ChIP、CO-IP、生物信息学分析、知识产权服务!【全国免费热线】:400-675-6758【电话】 023-65316016,023-65316556【邮箱】 china-western@163.com【官网网址】www.cqwestern.com【地址】 重庆市高新区二郎创业大道高科创业园 D 栋 2 楼
Illumina甲基化芯片(Illumina 850k芯片)的特点:1、唯一权威甲基化芯片,针对人源样本研究性价比最高;2、 高准确度可精确达到85万个甲基化位点;3、覆盖范围广,CpG岛及CpG岛以外均有覆盖;4、多种验证手段可供选择。5、流程简单,无需进行繁琐的免疫共沉淀;6、直接检测到发生甲基化的准确位点,而非发生甲基化的区段;7、可根据需求,灵活定制符合自己需求的个性化芯片;8、通量高,可一次性检测8个以上样品。Illumina甲基化芯片操作步骤:1、基因组DNA提取;2、亚硝酸盐处理基因组DNA;3、Illumina 850k芯片杂交4、单碱基延伸反应;5、芯片扫描;6、数据分析。Illumina甲基化芯片样本要求:1、基因组DNA的量≥1ug;2、OD260/280值在1.8和2.0之间3、干冰运输。 做实验,找威斯腾!【本平台合作项目】分子诊断、病理诊断、药效学评价、毒理学实验、细胞药筛、动物建模、PDX模型、CRISPR/Cas9基因编辑、病理检测、基因芯片、蛋白组学、代谢组学、高通量测序、ChIP、CO-IP、生物信息学分析、知识产权服务!【全国免费热线】:400-675-6758【电话】 023-65316016,023-65316556【邮箱】 china-western@163.com【官网网址】www.cqwestern.com【地址】 重庆市高新区二郎创业大道高科创业园 D 栋 2 楼
Agilent miRNA芯片技术特点 1. 唯一能通过特殊的探针设计区分成熟miRNA和miRNA前体的芯片平台;2. 无需分离miRNA,直接用Total RNA 进行实验,只需100ng的Total RNA 即可用来进行标记实验(不包括质检所消耗的量),避免了分离、富集、放大等过程带来的影响;3. 样品适用范围广:组织、血清、血浆、FFPE、冰冻切片组织、脱落细胞等均可进行实验;4. 高特异性:特殊的专利探针设计能区别一个碱基的差异;5. 高灵敏度:检测丰度跨4个log,最高可达6个log,只要存在6000个拷贝的分子就可以检出;6. 数据来源于Sanger 19.0版本,并方便及时更新;7. 人、大鼠、小鼠之外的动物物种,可以方便的通过earray进行个性化定制。miRNA芯片应用:检测miRNA表达水平、差异miRNA筛选、差异miRNA靶基因预测miRNA芯片应用:检测miRNA表达水平、差异miRNA筛选、差异miRNA靶基因预测miRNA芯片样品要求 :细胞、新鲜组织或总RNA样品。1、样品量:细胞样品请提供至少5×106个细胞,组织样品请提供至少100mg的组织块或切片。总RNA样品请提供总量10μg以上。2、样品质量:RNA无明显降解,OD260/280值在1.9和2.1之间,浓度≥ 100ng/μl;DNA应该去除干净。3、细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)直接液氮冻存后,-80℃保存。4、样品运输:细胞或者组织样品;或者总RNA样本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。 做实验,找威斯腾!【本平台合作项目】分子诊断、病理诊断、药效学评价、毒理学实验、细胞药筛、动物建模、PDX模型、CRISPR/Cas9基因编辑、病理检测、基因芯片、蛋白组学、代谢组学、高通量测序、ChIP、CO-IP、生物信息学分析、知识产权服务!【全国免费热线】:400-675-6758【电话】 023-65316016,023-65316556【邮箱】 china-western@163.com【官网网址】www.cqwestern.com【地址】 重庆市高新区二郎创业大道高科创业园 D 栋 2 楼
lncRNA研究的重要一步是发现与特定疾病相关的lncRNA。传统的lncRNA筛选方法(SELEX等)效率低下,假阳性率高。而基因芯片具有覆盖全面、高效、准确的特点,因此用基因芯片来筛选lncRNA是一种准确快捷的方法。二、lncRNA技术特点:1)目前市面上探针密度最高的lncRNA芯片产品;2)芯片采用Agilent eArray平台设计,使用Agilent SurePrint技术合成,技术重复性高于99%;3)覆盖主流数据库所有lncRNA,可同时检测lncRNA和mRNA,并挖掘两者之间的关联;4)检出率高:随机引物扩增方式,可同时扩增带Ploy-A和不带Poly-A的lncRNA,确保更多的 lncRNA被检测出来;5)提供完整lncRNA芯片数据分析解决方案。 三、lncRNA芯片服务流程:1、总RNA提取;2、反转录合成cDNA;3、体外转录合成cRNA;4、随机引物合成正义链cDNA5、DNA片段化,生物素标记;6、芯片杂交、洗涤、染色、扫描。四、样本要求:细胞、新鲜组织或总RNA样品1、提取RNA量≥1ug;2、细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)直接液氮冻存后,-80℃保存。3、样品运输:细胞或者组织样品;或者总RNA样本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。五、应用:筛选差异表达的lncRNA和mRNA、lncRNA功能注释、lncRNA调控机制预测 做实验,找威斯腾!【本平台合作项目】分子诊断、病理诊断、药效学评价、毒理学实验、细胞药筛、动物建模、PDX模型、CRISPR/Cas9基因编辑、病理检测、基因芯片、蛋白组学、代谢组学、高通量测序、ChIP、CO-IP、生物信息学分析、知识产权服务!【全国免费热线】:400-675-6758【电话】 023-65316016,023-65316556【邮箱】 china-western@163.com【官网网址】www.cqwestern.com【地址】 重庆市高新区二郎创业大道高科创业园 D 栋 2 楼